К самым значимым работам Воронихин относятся:
- Перестройка интерьеров Строгановского дворца на Невском проспекте 1791 - 1792 гг.;
- Строительство Казанского собора в 1801 - 1811 гг.;
- Реставрационные работы в Большом дворце Павловска в 1803 - 1807 гг.;
- Возведение здания Горного Института в 1806 - 1811 г.
Другие работы Андрея Никифоровича - колоннада Казанского собора и Эрмитажный каскад, расположенные в Петергофе, а также интерьеры дворцов Павловска, Гатчины и Стрельны.